Fondation Cardiometabolisme Et De Nutrit
Publiée hier · Paris
Data Scientist- Génomique, Single Cell & Transcriptomique Spatial (H/F)
- Paris
- CDI
- 45 k€ – 50 k€ / an
Description du poste
Pourquoi nous rejoindre
Rejoindre l'IHU ICAN, c'est mettre son expertise au service d'un enjeu de santé publique majeur, aux côtés d'équipes scientifiques et cliniques de premier plan.
- Un poste à fort impact : contribuer directement à la lutte contre la première cause évitable de maladies cardiovasculaires.
- Un environnement d'excellence : un institut de référence européen, au sein de l'hôpital de la Pitié-Salpêtrière.
Le poste Dans le cadre du développement de ses projets Single-Cell et Transcriptomique Spatiale, la plateforme ICAN I/O Data Science recrute un(e) ingénieur(e) ou chercheur(euse) pour renforcer ses activités d'analyse de données à haute résolution cellulaire et spatiale, et génomique humaine. Sous la responsabilité directe du responsable de la plateforme, le poste s'inscrit dans des projets à forte composante biologique et clinique, en interaction étroite avec des équipes expérimentales et cliniques.
Vos missions
- Single-Cell Transcriptomiques
- Analyse de données scRNA-seq / snRNA-seq
- Pré-traitement, contrôle qualité, normalisation
- Annotation cellulaire, identification de sous-populations
- Analyses de trajectoires, états cellulaires et plasticité
- Analyses de communication intercellulaire et régulation transcriptionnelle
- Transcriptomiques spatiales
- Analyse de données de spatial transcriptomics (10x Visium, Xenium, CosMx, MERFISH ou équivalents)
- Cartographie spatiale des populations et états cellulaires
- Intégration spatial / single-cell
- Interaction avec données histologiques
- Génomique (secondaire)
- Analyses de données WGS / WES / ciblées
- Mapping / alignement des reads (BWA, Bowtie2, etc.)
- Variant calling : SNPs, indels (GATK, bcftools, FreeBayes)
- Annotation fonctionnelle des variants (VEP, ANNOVAR)
- Analyses d'association GWAS
- Contribution à l'interprétation biologique des variants
- Data Science et analyses statistiques
- Analyses statistiques classiques pour les études cliniques et omiques (statistiques desc
Annonce publiée sur France Travail et reprise par Intelligence Academy. Seule l'annonce d'origine fait foi ; nous ne sommes pas l'employeur.
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